苏震实验室

 

工作人员:
		苏震: 教授  [个人网页] 生物信息学、计算生物学和功能基因组学研究, 构建重要动植物功能基因组综合信息平台, 重点研究植物基因表达调控机制
在读研究生:
		于新月： 博士研究生，2020年入学 研究方向： 高通量数据整合与平台构建
		张心怡： 硕士研究生，2021年入学 研究方向： 高通量数据整合与平台构建

已离开实验室成员:

徐文英：高级工程师

刘凤霞：博士后，2006至2008年；目前是中国农业大学农学院副教授

张一婧：博士后，2008至2009年；目前是复旦大学生命科学学院教授

凌毅：博士研究生，2005至2008年； 毕业论文题目《拟南芥蛋白激酶综合知识库的建立及玉米信号转导相关家族基因的分类注释》；目前是中国农业大学生物学院副教授

周鑫：博士研究生，2004至2008年，毕业论文题目《生物信息学网络服务构建与基因转录的计算机模拟》；目前在美国St. Jude Children's Research Hospital工作

焦远年：硕士研究生，2004至2006年； 目前是中科院植物所研究员

刘云岩：硕士研究生 (合作指导)，2004至2006年，毕业论文题目《截型苜蓿生物数据分析平台的构建和耐盐相关基因的预测与验证》；目前在SAS公司工作

武海燕：博士研究生 (合作指导)，2005至2009年，毕业论文题目《基于Affymetrix Genechip®芯片和454测序技术的SNP多态性位点预测及验证》；目前在罗氏制药工作

付俊杰：博士研究生 (合作指导)，2004至2008年，毕业论文题目《玉米渗透胁迫相关基因表达谱分析与全长cDNA收集》；目前是中国农业科学院研究员

刘充：硕士研究生，2005至2008年，毕业论文题目《通过比较基因组学手段建立一种 适冷基因挖掘的方法 》；目前在北京市“一起作业网”工作

于景印：硕士研究生，2006至2009年，毕业论文题目《水稻细胞色素P450功能基因组学数据挖掘和数据库构建》； 目前在浙江省湘湖实验室工作

李道丰：博士研究生 (合作指导)，2005至2011年，毕业论文题目《苜蓿逆境胁迫转录谱分析与胁迫响应基因的挖掘》；目前是美国华盛顿大学Assistant Professor

邸超：博士研究生，2006至2011年，毕业论文题目《JAZ、PHB基因家族的系统生物学分析及拟南芥关键家族基因的功能研究 》；目前在美国Spark Therapeutics, Inc.工作

杨仁东：博士研究生，2006至2011年，毕业论文题目《节律性表达基因的高通量识别算法与转录组学分析》；目前是美国Northwestern University医学院的Associate Professor

杜舟：博士研究生，2007至2012年，毕业论文题目《植物表观遗传组与功能基因组数据挖掘与工具开发》；目前在Takeda Pharmaceutical Company Limited工作

张盖华：博士研究生，2007至2012年，毕业论文题目《蛋白质结构与进化分析和植物细胞色素P450的结构建模》；目前 是湖南师范大学副教授

张振海：博士研究生，2007至2012年，毕业论文题目《生物过程关联网络的研究和大豆功能基因组学数据库的构建》；目前在北京市地铁运营有限公司工作

魏强：博士研究生，2009至2012年，毕业论文题目《水稻OsSPX1基因影响叶片抗氧化性、花粉育性和种子结实率的功能研究及水稻转录组数据挖掘实例分析》；目前是中国药科大学原创药物技术创新研究院教授

姚冬霞：博士研究生，2008至2013年， 毕业论文题目《棉花应答盐胁迫和干旱胁迫的基因芯片表达谱和小RNA测序数据分析》；目前在浙江工作

魏建刚：硕士研究生，2010至2013年，毕业论文题目《植物脂质代谢相关途径基因组学数据库构建》；目前在北京工作

鲁亮群：硕士研究生，2010至2013年，毕业论文题目《植物中碳水化合物活性酶的数据库构建》 ；目前在美国工作

于娟：博士研究生，2009至2014年，毕业论文题目《拟南芥JAZ7基因参与黑暗诱导叶片衰老的分子机制研究以及玉米转录组学数据整合分析平台的初步构建》 ；目前是中国科学院生物物理研究所副研究员

苗震龑：博士研究生 (合作指导)，2009至2014年，毕业论文题目《黄花苜蓿非生物胁迫数据挖掘与系统分析》；目前是西北农林科技大学生命科学学院教授

王春超：博士研究生，2009至2014年，毕业论文题目《基于多维组学数据挖掘研究拟南芥AtSPX1基因的新功能以及OsSPX1对苗期水稻抗氧化性的影响》；目前在中国农业科学院作物所工作

郭金艳：博士研究生(合作指导)，2009至2015年，毕业论文题目《耐盐性不同的棉花根系转录组比较分析及耐盐基因挖掘》；目前在河北工作

张力圩：博士研究生，2011至2016年，毕业论文题目《棉花功能基因组学平台构建和非编码转录组学数据挖掘》；目前 中国农业大学营养与健康系副教授

易欣：博士研究生，2011至2016年，毕业论文题目《综合分析组学数据以构建植物基因结构注释与功能解析平台》；目前在中国科学院植物所工作

张康：博士研究生，2012至2017年，毕业论文题目《系统分析水稻H2A.Z的分布特征并探索其与基因表达的相关性》；目前是河北农业大学生命科学学院的教授

尤琪：博士研究生，2012至2017年，毕业论文题目《组学数据整合与功能模块化分析构建棉花全基因组注释体系》；目前是扬州大学副教授

刘悦：博士研究生，2013至2018年，毕业论文题目《构建植物染色质状态数据库并研究黑暗胁迫下表观调控机制》；目前在青岛农业大学园艺学院工作

宋倩：博士研究生，2014至2018年，毕业论文题目《基于多维组学数据分析挖掘并验证拟南芥PHO1;H10基因功能》 ；目前在北京纪凯知识产权代理有限公司工作

田甜：博士研究生，2014至2019年，毕业论文题目《构建玉米多维组学数据整合分析平台并挖掘重要基因功能模块》；目前是北京科技大学生物农业研究院副研究员

闫恒宇：博士研究生，2014至2019年，毕业论文题目《基于多组学数据分析探索AtSPX1及其相关蛋白影响拟南芥叶片衰老的分子机制》；目前在青岛农业大学工作

杨教童：博士研究生，2014至2019年，毕业论文题目《植物EAR基序蛋白功能分析平台构建与应用》；目前在贵州中医药大学工作

崔志创：硕士研究生，2017至2019年，毕业论文题目《人参、三七胡萝卜的组学数据整合与共表达网络构建》

佘加杰：博士研究生，2015至2020年，毕业论文题目《基于多维组学数据整合构建番茄和长春花全基因组注释体系》；目前在深圳第二人民医院做博士后

赵楠楠：博士研究生，2015至2020年，毕业论文题目《HDA710/OsHDAC2调控水稻叶片衰老和分生分化的功能预测及实验验证》；目前在天津医科大学 工作

达玲玲：博士研究生，2015至2020年，毕业论文题目《构建蔷薇科植物苹果的多维组学数据整合分析平台》；目前是西北师范大学生命科学学院副教授

马雪莲：博士研究生，2016至2021年，毕业论文题目《基于组学数据提高毛竹全基因组精细注释及构建PlantGSEAv2平台》；目前在中山大学附属第七医院工作

盛铭浩：博士研究生，2016至2022年，毕业论文题目《多组学方法探究水稻KNOXII转录因子HOS59的功能和分子调控机制》；目前在北京百奥智汇科技有限公司工作

李中秋：博士研究生，2017至2022年，毕业论文题目《麦类多维组学数据整合分析平台的构建》；目前在北京解放军总医院第七医学中心工作

曹亚欣：博士研究生，2019至2024年，毕业论文题目《基于多组学分析探索核纤层类似蛋白KAKU4调控叶片衰老的机制》；目前在中国科学院遗传与发育生物学研究所做博士后

薛天玺：博士研究生，2020至2024年，毕业论文题目《多组学数据分析探索棉花SBT家族基因功能》；目前在中国科学院微生物研究所做博士后

金虹：硕士研究生，2022至2024年，毕业论文题目《长春花细胞色素P450家族基因组蛋白修饰H3K4me3和H3K27me3的特征分析》；目前在 浙江寿仙谷医药股份有限公司工作

梁亚伟：硕士研究生，2022至2024年，毕业论文题目《基于表观基因组学数据分析探索水稻响应氧化胁迫的分子调控机制》；目前在 中国农业科学院攻读博士

张群连：实验员，2004年至2022年，从事植物培养及转基因工作。

赵庆伟：硕士研究生 (合作指导)，2005至2007年，毕业论文题目《基因芯片数据的三维数据分析模型探讨》

张祖勇：硕士研究生，2006至2007年来实验室交流学习

郭华军：硕士研究生 (合作指导)，2006至2009年，毕业论文题目《拟南芥转录因子GRAS家族SCL15基因对干旱胁迫的响应分析》

周少霞：研究助理，2005至2006年 ；目前在南京农业大学工作

黎江：程序员，2005年；目前在广西工作

刘岚：研究助理，2006至2008年

郑雪：研究助理，2006至2008年

王玲：研究助理，2009至2010年；目前在成都工作

谭远军：研究助理，2009至2010年；目前在杭州工作

解超：本科生毕业设计，2004至2005年，毕业论文题目《拟南芥激酶基因序列筛选》；目前 已从北京大学获得博士学位，在中国交通通信信息中心工作

付彪：本科生URP训练

胡淼：本科生毕业设计，2005至2006年

李黎：本科生毕业设计，2005至2006年，构建“泛素化相关基因数据库”；目前在华大基因欧洲中心工作

王川：本科生毕业设计，2006至2007年，毕业论文题目《水稻过氧化物酶(peroxidase)数据库建设》；目前在美国做博士后

王斌：本科生毕业设计，2006至2007年

易泽轩：本科生URP训练

朱莹婷： 本科生URP训练

李晓：本科生URP训练；目前在美国the Broad Institute of MIT and Harvard工作

张妍：本科生URP训练

张臣：2009年北京市大学生科学研究与创业行动计划《时间序列模型在昼夜节律分析中的应用与研究》

徐玄昊：2010年生物学院本科生创新基金《植物分泌蛋白数据库的完善》

杨周拓：2010年国家大学生创新性实验计划《昼夜节律生物芯片数据分析平台的开发与应用》

朱鑫：2010年国家大学生创新性实验计划《昼夜节律生物芯片数据分析平台的开发与应用》

宋孟哲 (James Song)：2018年中学生暑期实习《鸟类生物信息学目录》，时为河南省实验中学高二学生